एक mysterious traveller कराची की underbelly के दिल में चुपचाप घुस जाता है और lethal precision के साथ वहाँ की रैंक्स में ऊपर उठता चला जाता है, लेकिन उसका असली मक़सद अंदर से ही कुख्यात ISI–Underworld nexus को पूरी तरह तबाह करना होता है।
अजय सान्याल ने पाकिस्तान की तरफ़ से भारत पर हुए कई unusual attacks देखे हैं, जिनमें बहुत सी जानें गई हैं। उसकी failed strategy के लिए उसके seniors उसी को दोषी मानते हैं। हालात बदलने के लिए सान्याल एक secret operation प्लान करता है, जिसका नाम होता है “धुरंधर”।
हम्ज़ा, एक spy, पाकिस्तान में एंटर करता है, उसका मिशन भारत पर होने वाले हमलों की प्लानिंग करने वाले terrorism networks को तोड़ना होता है। उसका शुरुआती प्लान है रहमान डकैत के गैंग में घुसना, जो एक बेहद powerful gangster है और जिसका बहुत बड़ा नेटवर्क है। ये मिशन लगभग impossible लगता है, लेकिन एक और स्पाई आलम की मदद से हम्ज़ा किसी तरह गैंग में एंटर कर जाता है।
धीरे-धीरे हम्ज़ा रहमान का trustworthy aide बन जाता है और आलम के ज़रिए RAW को लगातार information भेजने लगता है। इसी बीच रहमान की नज़र आने वाले elections पर होती है। उसका मेंटर जमील जमाली अपनी सीट हारने के डर से SP Aslam Chaudhary की मदद लेकर रहमान को एलिमिनेट करने का फैसला करता है।
हम्ज़ा और ज़्यादा terror networks की तलाश में रहता है और एक मौके पर रहमान की जान बचा लेता है। लेकिन उसे ये अंदाज़ा नहीं होता कि इस रास्ते पर चलकर उसने अपने लिए एक बहुत बड़ी destruction को न्योता दे दिया है।
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